Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL4Q14135 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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