Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms