Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCINQ13939 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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