Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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