Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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SHROOM2Q13796 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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