Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMC2Q13753 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAMC2Q13753 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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