Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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