Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms