Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCH1Q13635 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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