Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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