Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE3BQ13370 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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