Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP140Q13342 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SP140Q13342 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SP140Q13342 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP140Q13342 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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