Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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