Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms