Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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