Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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