Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF2Q12933 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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