Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A2Q12908 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms