Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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