Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms