Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms