Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms