Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms