Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms