Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms