Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms