Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms