Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms