Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLCB3Q01970 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms