Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms