Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms