Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms