Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEF1A1P68104 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1A1P68104 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1A1P68104 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1A1P68104 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1A1P68104 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEF1A1P68104 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms