Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABP4P57796 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms