Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2BFSP57053 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2BFSP57053 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2BFSP57053 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2BFSP57053 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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