Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms