Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms