Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52P55327 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52P55327 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52P55327 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms