Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PGGT1BP53609 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PGGT1BP53609 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PGGT1BP53609 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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