Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX2P52951 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX2P52951 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms