Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms