Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP5P45974 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP5P45974 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP5P45974 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP5P45974 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms