Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCAMP43121 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCAMP43121 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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