Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAEP38570 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms