Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms