Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms