Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG3P32926 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG3P32926 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG3P32926 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG3P32926 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG3P32926 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSG3P32926 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSG3P32926 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSG3P32926 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSG3P32926 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms