Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms