Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALDH4A1P30038 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH4A1P30038 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms