Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms